A space for the upstream activities of documenting clinical and epidemiological research concerning COVID-19.


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Motivation

Hintergrund der Aktivitäten ist die Idee eines Schnellstarts von NFDI4Health aufgrund der dringlichen Entwicklungen der Coronapandemie. Obwohl eine frühere Förderung über NFDI nicht möglich ist, soll ein Vorprojekt über die DFG beantragt werden. Eines der aktuell nicht breit bearbeiteten Felder, die aber zum Arbeitsschwerpunkt der NFDI4Health-Partner zählen, sind Informationen zu laufenden medizinischen Studien.

Leitbild

Aufgabe dieses Vorprojekts ist der Aufbau einer semistrukturierten Sammlung von Informationen zu aktuell laufenden Studien in Deutschland mit Bezug zu COVID-19. Dazu wurde ein Projekt im FAIRDOMHub eingerichtet. Diese Daten sollen mittelfristig von der Informationsseite der ZBMED ausgelesen und dargestellt werden (über die SEEK API).

Abbildung in SEEK

Basale Datenstruktur

Investigation: Das Konsortium, Netzwerk, Verbundprojekt etc., welches hinter der Studie steht

Study: Ein konkretes Forschungsprojekt mit Datenerfassung/Auswertung

Assay: Dokumente zur Study

Klassifikation von Studien

Klassifikation von Dokumenten (Assay-Type)

  • Studienprotokoll:
  • Amendment:
  • Ethikvotum:
  • Data Dictionary:
  • Case Report Form:
  • Annotierter Case Report Form:
  • Datenschutzkonzept:
  • Datenschutzstellungnahme:
  • Data Management Plan:


  Technology-Type:

  • File/s: Excel
  • File/s: PDF
  • File/s: Text

Offene Fragen

Welche Entitäten sollen schwerpunktmäßig erfasst werden?

Der Fokus liegt auf strukturierten Datenerfassungen wie klinische Studien, Registern, Kohorten und Surveys. Es muss kein Patientenbezug bestehen, sondern es werden auch Studien zu Spätfolgen, Psyche, Testgüte etc. betrachtet.

Nicht im Fokus liegen Werkzeuge, Forschungsverbünde, Förderprogramme.

Welche Artefakte sollen gesammelt werden?

Gesammelt werden:

  • Kurzbeschreibungen (Text)
  • Dokumente
  • Datensätze

Welche Rolle nimmt diese Sammlung ein im Vergleich zu den anderen Portalen von ZBMED, RKI, BIPS etc.?

Unklar. Wahrscheinlich ergänzend. Ein Ersatz der andewren Portale erscheint nicht wahrscheinlich.

Welche Zielgruppen sollen diese Sammlung wofür nutzen?

Forscher zum Kontakt untereinander, verhindern von Doppelforschung.

Wie ist die Relation von Dokument zu ISA?

Dokumente scheinen zu Projekten zu gehören, können dann aber auch z.B. Assay zugeteilt werden. Dokumente können so mehrfach eingehängt werden. Ein Studienprotokoll wäre demnach als Dokument abzubilden. Dann würde man ein Assay anlegen, welches alle Dokumente einer Studie enthält. Nur für Assays lassen sich Hierarchien aus ASSAY_TYPE und TECHNOLOGY_TYPE aufbauen.

Sollen wir alle Studien einschließen oder die Menge kuratieren?

Manche Studien sind fern des Fachgebiets.

Brauchen wir Studienregister außer dem DRKS? Sind mache Studien (nur) dort?

Woher bekommen wir CRFs?

Woher bekommen wir ODM?

Probleme oder ev. problematische Punkte

Der Projektname ist "COVID-19 related studies and tools in Germany", aber Tools sollen nicht rein.

Titel korrigieren.

Bei der Anzeige einer Studie wird nicht der echte Ansprechpartner angezeigt, sondern derjenige, der die Studie eingetragen hat.

Beispiel: LEOSS.core zeigt Uli Sax als Ansprechpartner ("Person responsible: Ulrich Sax"). Das kann verwirren.

Studien müssen als übergeordnete Struktur eine Investigation haben, was machen, falls es keine natürliche Struktur gibt?

Tags werden beim Anlegen nicht gespeichert: Bug?




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